植物細胞組織培養，如食用菌生產、桉樹苗接種等操作對生產環境的要求較高，因此在操作和培養過程中，最重要的是防止細菌等的感染，無菌設備非常重要。按照國外的經驗，一般植物組培實驗室和生產車間應該是在無菌環境下生產，但由于無菌室建造及運行、維護成本較高，目前在國內還不能廣泛普及。國內主要目前采用的是局部凈化，超凈工作臺已經成為了，組培超凈工作臺目前已經廣泛應用于植物組培，實驗室，食用菌生產等環境。部分食用菌組培采用流水線接種超凈臺，稱之為流水線超凈臺。

無菌室主要用于植物材料的消毒、接種、培養物的繼代轉移等。這里是植物組織培養研究中最關鍵的部分，關系到培養物的污染率．接種工作教率等重要指標要求地面、天花板、四壁盡可能光潔、無塵，易于采取各種清沽和消毒措施。

  接種無菌室一般設內外兩間，外間小些為準備室（供操作人員更換工作服、工作帽、拖鞋，洗手及處理外界采樣準備，更衣洗手消毒后進入風淋室，把進入車間的人員身的灰塵吹掉，避免員工將毛發等帶入車間。然后通過傳遞窗將無菌培養材料殺菌后送入接種室，以防止帶人病菌，保證無菌室能長時間和大量進行無菌操作）。內間稍大，供接種用。

無苗室內應安有紫外線殺菌燈或臭氧發生器，在操作前至少開燈20min。同時室內應定期用甲醛和高錳酸鉀蒸氣熏蒸(或用70%酒精或0.5%苯酚嘖霧降塵和消毒)。無菌操作室需備有固定式載物臺、移動式載物臺、廣口瓶、酒精燈、酒精棉、器械支架、手術剪、解剖刀、解剖針、鑷子等用于接種。近年來，多數實驗室都采用超凈工作臺來代替無菌操作室。超凈工作臺不僅操作方便，而且效果也很好。